Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GLB2Q9NR46 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GLB2Q9NR46 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GLB2Q9NR46 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GLB2Q9NR46 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GLB2Q9NR46 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms