Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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