Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms