Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms