Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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