Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDC1Q9BTX1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms