Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP47Q96K76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms