Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms