Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1Q86WP2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms