Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA2Q15822 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms