Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms