Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms