Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElocP83940 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElocP83940 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElocP83940 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElocP83940 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElocP83940 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElocP83940 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElocP83940 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms