Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC4P56524 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC4P56524 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC4P56524 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC4P56524 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC4P56524 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC4P56524 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms