Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4P46934 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms