Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms