Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNCP24821 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNCP24821 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNCP24821 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNCP24821 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms