Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SELENOFO60613 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SELENOFO60613 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms