Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRC1O43663 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRC1O43663 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRC1O43663 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRC1O43663 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRC1O43663 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRC1O43663 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRC1O43663 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRC1O43663 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms