Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.989e-7■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.969e-7■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 GREB1-208ENST00000470980 833 ntTSL 39.33□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.434e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.294e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 323.04■■□□□ 1.284e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.644e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 513.67□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.221e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 513.67□□□□□ -0.221e-8■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 312.96□□□□□ -0.335e-11■■■■□ 21.1
PRPF4O43172 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.126e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.116e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.446e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.685e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 319.12■□□□□ 0.652e-17■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.998e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.18e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.098e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.048e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 514.14□□□□□ -0.158e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.421e-18■■■■□ 21
PRPF4O43172 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-18■■■■□ 21
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-8■■■■□ 21
PRPF4O43172 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.963e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.743e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-211ENST00000592700 1602 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 21
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PRPF4O43172 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS15-213ENST00000617694 338 ntTSL 311.03□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 21
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PRPF4O43172 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.591e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.581e-6■■■■□ 21
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PRPF4O43172 IZUMO4-207ENST00000498554 929 ntTSL 521.46■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 FBXL8-205ENST00000519378 586 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-210ENST00000475757 1073 ntTSL 219.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 FBXL8-202ENST00000517382 543 ntTSL 319.23■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 21
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PRPF4O43172 FBXL8-209ENST00000523893 559 ntTSL 418.41■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 FBXL8-207ENST00000519945 699 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-221ENST00000582993 565 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-223ENST00000583689 563 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-228ENST00000584409 545 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 416.35■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-213ENST00000531240 559 ntTSL 414.88□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-208ENST00000440228 620 ntTSL 414.85□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-218ENST00000582359 694 ntTSL 314.64□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-205ENST00000578862 549 ntTSL 414.08□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-208ENST00000579837 418 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-216ENST00000582118 560 ntTSL 413.79□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 MTMR4-203ENST00000579921 425 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-229ENST00000585240 554 ntTSL 413.01□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 IZUMO4-208ENST00000588003 510 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-217ENST00000582168 863 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-226ENST00000583989 463 ntTSL 411.35□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 21
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