Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stub1Q9WUD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms