Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms