Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms