Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms