Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms