Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska1Q9CPV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms