Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc58Q8R3Q6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms