Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed3Q78IS1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed3Q78IS1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms