Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms