Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EEF1A1P5Q5VTE0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms