Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc1Q5NCF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trappc1Q5NCF2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trappc1Q5NCF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trappc1Q5NCF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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