Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SvipQ3UZP4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SvipQ3UZP4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms