Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm648Q3UJ22 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms