Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms