Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SWI5Q1ZZU3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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