Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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