Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOA4Q13772 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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