Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLN3Q13286 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CLN3Q13286 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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