Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms