Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms