Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms