Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LMO4P61968 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LMO4P61968 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LMO4P61968 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms