Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP7P55210 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASP7P55210 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms