Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPD2P43304 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPD2P43304 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPD2P43304 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPD2P43304 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPD2P43304 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPD2P43304 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms