Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 YER135CYER135C 393 nt2.98□□□□□ -1.93
NIC96P34077 BET3YKR068C 582 nt2.98□□□□□ -1.93
NIC96P34077 URA10YMR271C 684 nt2.98□□□□□ -1.93
NIC96P34077 snR54snR54 86 nt2.98□□□□□ -1.93
NIC96P34077 DBP7YKR024C 2229 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 REC8YPR007C 2043 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 CHS2YBR038W 2892 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 COQ10YOL008W 624 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 SSE1YPL106C 2082 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 RSN1YMR266W 2862 nt2.97□□□□□ -1.93
NIC96P34077 FRE2YKL220C 2136 nt2.96□□□□□ -1.93
NIC96P34077 HFD1YMR110C 1599 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 PES4YFR023W 1836 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 ROG1YGL144C 2058 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 GPI8YDR331W 1236 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 RRT13YER066W 558 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 GPI14YJR013W 1212 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 DGK1YOR311C 873 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 TRM7YBR061C 933 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 UTP14YML093W 2700 nt2.96□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SHQ1YIL104C 1524 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SWF1YDR126W 1011 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YHR125WYHR125W 306 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 RNP1YLL046C 750 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SDC25YLL016W 3147 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 DYN1YKR054C 12279 nt2.95□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YHR080CYHR080C 4038 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 CIN8YEL061C 3003 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 HYR1YIR037W 492 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YJR079WYJR079W 330 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 AIM26YKL037W 357 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 GOT1YMR292W 417 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 CRS5YOR031W 210 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YBR197CYBR197C 654 nt2.94□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SSY1YDR160W 2559 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 NDT80YHR124W 1884 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YDR133CYDR133C 336 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 CRG1YHR209W 876 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YML084WYML084W 309 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YOL134CYOL134C 390 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 GPX2YBR244W 489 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 NAB3YPL190C 2409 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 UBP14YBR058C 2346 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YNR063WYNR063W 1824 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 RGA2YDR379W 3030 nt2.93□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SUL1YBR294W 2580 nt2.92□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YBL071CYBL071C 309 nt2.92□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.92□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YBR285WYBR285W 435 nt2.92□□□□□ -1.94
NIC96P34077 BRO1YPL084W 2535 nt2.92□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YLR269CYLR269C 351 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YLR458WYLR458W 381 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YML003WYML003W 873 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SIP18YMR175W 240 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YOR053WYOR053W 342 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YOR105WYOR105W 327 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 SLM6YBR266C 453 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 MGR1YCL044C 1254 nt2.91□□□□□ -1.94
NIC96P34077 ASG1YIL130W 2895 nt2.9□□□□□ -1.94
NIC96P34077 YLR278CYLR278C 4026 nt2.9□□□□□ -1.94
NIC96P34077 INP52YNL106C 3552 nt2.9□□□□□ -1.94
NIC96P34077 NFT1YKR103W 3657 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 FMP32YFL046W 624 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 YGL165CYGL165C 579 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 LCL2YLR104W 396 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 RPL36AYMR194W 303 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 RPS7BYNL096C 573 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 YPR089WYPR089W 2667 nt2.9□□□□□ -1.95
NIC96P34077 RNH70YGR276C 1662 nt2.89□□□□□ -1.95
NIC96P34077 SLH1YGR271W 5904 nt2.89□□□□□ -1.95
NIC96P34077 GEA1YJR031C 4227 nt2.89□□□□□ -1.95
NIC96P34077 YJL202CYJL202C 348 nt2.89□□□□□ -1.95
NIC96P34077 RAM2YKL019W 951 nt2.89□□□□□ -1.95
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