Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC13P31276 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC13P31276 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC13P31276 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC13P31276 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms