Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou2f1P25425 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou2f1P25425 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms