Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN2P17655 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms