Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms