Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F8A0AVK6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms